MBG 326Introduction to Bioinformatics
Bilkent Moleküler Biyoloji ve Genetik dersi. Genelde yalnızca Güz'de açılır, son 5 yılda yaz okulunda açılmadı. Şube başına ortalama 50 öğrenci.
- kredi3· 5 ECTS
- haftalık3 saat3 ders
- son 5 yıl ort.3,02B+ ↘
- açılıryalnızca Güzson 5 yıl
- 2026-2027 Güz1 şube· 3 boş yer
2026-2027 Güz şubeleri52/55 dolu · %95
- 1Özlen Konu Karakayalıbu dersteki ortalaması 3,02
- Çar 08:30–09:20SB-Z03 · yedek
- Çar 09:30–10:20SB-Z03
- Cum 13:30–15:20SB-Z03
3 boş · 52/55
Saat ızgarası Pazartesi–Cuma, 08:30'dan itibaren; mavi lab, mor online, gri yedek (spare) saat. Kontenjan STARS offerings'ten her gün alınır; kesin bilgi SRS'te.
Ön koşullar ve açtığı derslerkatalogda ön koşul yok
Almak için
Ön koşulu yok, doğrudan alınabilir.
- ön koşul
- yok
- doğrudan açtığı
- 0 ders
Geçince açılır
Başka bir dersin ön koşulu değil.
Ön koşullar STARS kataloğundaki ifadeden okunur; eş koşul, izin ve not şartları dahil değil. Kartın altındaki not o dersin başka neye ihtiyaç duyduğunu söyler.
Not ortalaması5 yıl 3,02 · 10 yıl 2,95 · 1999'den beri 3,05
- Güz / Bahar ortalaması
- son 5 yıl 3,02
- dikey gölge: şube aralığı · nokta büyüklüğü: öğrenci sayısı
Şubelere göre dağılım
Bir noktanın üstüne gel ya da dokun: şube ve hocası görünür.
Her nokta bir şube. Yatay çizgi en düşük–en yüksek, dikey çizgi ortanca; soluk noktalar 10 öğrenciden az olan şubeler.
Dönem tablosu 10 dönem
| Dönem | Şube | Öğrenci | Ders ort. | Şube aralığı |
|---|---|---|---|---|
| 2025-2026 Güz | 1 | 58 | 3,02 | 3,02 |
| 2024-2025 Güz | 1 | 63 | 2,89 | 2,89 |
| 2023-2024 Güz | 1 | 53 | 3,09 | 3,09 |
| 2022-2023 Güz | 1 | 43 | 3,41 | 3,41 |
| 2021-2022 Güz | 1 | 35 | 2,64 | 2,64 |
| 2020-2021 Güz | 1 | 65 | 3,25 | 3,25 |
| 2019-2020 Güz | 1 | 66 | 2,75 | 2,75 |
| 2018-2019 Güz | 1 | 59 | 2,73 | 2,73 |
| 2017-2018 Güz | 2 | 85 | 2,88 | 2,80–2,97 |
| 2016-2017 Güz | 1 | 52 | 2,87 | 2,87 |
Dönem ortalaması STARS'ın "Course GPA" değeri (o dönemin tüm şubeleri). Çok yıllık ortalama dönem ortalamalarının öğrenci sayısıyla ağırlıklı ortalaması; "son 5 yıl" içinde bulunulan akademik yıldan önceki 5 tam yıl. 10 öğrenciden az olan dönemler (*) dahil ama soluk. Final tekrar dönemleri dahil değil.
Hocalara göre2021–2026 · 1 hoca
- Özlen Konu Karakayalıbu dönem5 dönem · 252 öğrenci · son 2025-2026 Güz3,02
Hocanın tek başına verdiği şubelerin öğrenci sayısıyla ağırlıklı STARS şube ortalaması. Soluk satırlar 20 öğrenciden az notlu veriye dayanır.
Değerlendirme ve FZ2026-2027 Güz syllabus'ı · koordinatör Özlen Konu Karakayalı
- %10Homework/Class Participation×5
- %20Midterm I
- %25Final Exam (Comprehensive)
- %20Midterm II
- %20Moodle or in class Quiz on lab material/worksheets×4
- %2,5ppt presentation and report of an RNAseq dataset
- %2,5Analysis of a GEO RNAseq dataset in lab
to have two midterm grades; IMPORTANT NOTE: this course is BIOLOGICAL in nature. There will be NO CHEATSHEETS provided in midterms or the final. There will be at least one hour/week lab hour that you need to attend. This course requires a VERY GOOD understanding of molecular biology and genetics and their applications. There will be biological research articles that use bioinformatics for additional reading, which will be on the exams.
syllabus'taki metin, olduğu gibiECTS iş yükü: dönem başına 152,5 saat.
MBG 326 not hesaplayıcısı hazır
Homework/Class Participation (5 adet) %10 · Midterm I %20 · Final Exam (Comprehensive) %25 · Midterm II %20 · Moodle or in class Quiz on lab material/worksheets (4 adet) %20 · ppt presentation and report of an RNAseq dataset %2.5 · Analysis of a GEO RNAseq dataset in lab %2.5Ders içeriği
Introduction to Bioinformatics: Computer use in molecular biology, access to online databases, sequence alignment, phylogenetics, RNA expression analysis, GWAS statistics, gene networks.
Haftalık konular 14 hafta
- Syllabus; Introduction: cells; DNA, RNA, protein: genetics, replication, transcription, translation. Homework 1a.
- Homework 1b. R programming basics lab: scalars, vectors, matrices, lists and indexing. Datacamp R introduction. Transcription, RNA-sequencing
- Homework 2a. R programming basics: basic plotting and ggplot2; Databases: NCBI, Ensembl, UCSC, BLAST; sequence alignment
- QUIZ 1. Introduction to R (vectors, scalars, matrices, lists, factors and basic stats and plotting); Hypothesis testing, multiple test correction
- Homework 2b. tidyverse; R programming basics lab: ggplot2 and dplyr. Genomics-transcriptomics examples
- Homework 3a. QUIZ 2: dplyr, ggplot2; R programming basics:Intermediate R (conditionals, loops and apply).
- Homework 3b. Intermediate R; Differential Expression, Statistics; programming basics lab: Writing Functions in R;
- MIDTERM I (writen/essay-closed book, weeks 1-8)
- Homework 4a. Clustering and PCA.
- QUIZ 3: limma and unsupervised learning; tSNE and UMAP and scRNAseq
- Homework 4b. Machine Learning and Prediction
- MIDTERM II (written/essay-closed book, weeks 7-12). Metabolomics and Lipidomics
- Homework 5a. RNAseq project and presentation prep: data selection and practice
- Homework 5b. QUIZ4: Machine learning; RNAseq project completion.
Ders kitabı 4
- Required - Reading: Weekly readings will be announced
- Required - Web Link: datacamp
- Recommended - Textbook: Computational Genomics with R, Altuna Akalin, 1st edition, selected chapters
- Required - Hardware: Laptop computer with R installed
Müfredatlarda5 program
- Bilgisayar MühendisliğiComputer Engineering · lisansTechnical Elective
- Elektrik-Elektronik MühendisliğiElectrical - Electronics Engineering · lisansMathematics / Science Elective
- FizikPhysics · lisansTechnical Elective
- Moleküler Biyoloji ve GenetikMolecular Biology and Genetics · lisansRestricted Elective
- Moleküler Biyoloji ve GenetikMinor Program for Molecular Biology and Genetics · yan dalElective
Sık sorulanlar
MBG 326 dersinin ön koşulu nedir?
STARS kataloğunda MBG 326 için ön koşul belirtilmemiş.
MBG 326 kaç kredi, kaç ECTS?
MBG 326 3 Bilkent kredisi ve 5 ECTS. Haftalık 3 saat yüz yüze ders.
MBG 326 hangi dönemlerde açılır?
Genelde yalnızca Güz'de açılır, son 5 yılda yaz okulunda açılmadı. 2026-2027 Güz döneminde 1 şube ile açık.
MBG 326 not ortalaması kaç?
MBG 326 dersinin son 5 akademik yıldaki ortalaması 3,02 (B+); 252 öğrencinin notundan, STARS'ın dönem ortalamaları öğrenci sayısıyla ağırlıklandırılarak hesaplandı.
MBG 326 FZ şartı nedir?
2026-2027 Güz syllabus'ına göre: to have two midterm grades; IMPORTANT NOTE: this course is BIOLOGICAL in nature. There will be NO CHEATSHEETS provided in midterms or the final. There will be at least one hour/week lab hour that you need to attend. This course requires a VERY GOOD understanding of molecular biology and genetics and their applications. There will be biological research articles that use bioinformatics for additional reading, which will be on the exams.
Veri STARS'ın herkese açık sayfalarından (offerings, katalog, ders geçmişi, syllabus) otomatik alınır. Şube, hoca ve kontenjan değişebilir; kesin bilgi için SRS'yi kontrol et.